Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna3Q65CL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna3Q65CL1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms