Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms