Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms