Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lcn4Q62472 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lcn4Q62472 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms