Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Epha6Q62413 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epha6Q62413 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms