Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl12Q62401 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl12Q62401 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl12Q62401 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl12Q62401 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl12Q62401 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms