Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Taf6Q62311 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms