Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sos1Q62245 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sos1Q62245 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sos1Q62245 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sos1Q62245 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sos1Q62245 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sos1Q62245 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms