Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf1Q62187 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ttf1Q62187 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ttf1Q62187 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf1Q62187 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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