Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Odf1Q61999 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Odf1Q61999 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Odf1Q61999 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Odf1Q61999 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Odf1Q61999 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Odf1Q61999 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Odf1Q61999 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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