Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt33bQ61897 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt33bQ61897 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms