Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gp49aQ61450 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp49aQ61450 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms