Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnna2Q61301 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms