Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AcanQ61282 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AcanQ61282 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms