Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf9Q61179 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf9Q61179 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf9Q61179 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms