Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc1Q61056 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms