Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna1Q60960 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kpna1Q60960 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms