Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppp1r1bQ60829 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp1r1bQ60829 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms