Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2dQ60773 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2dQ60773 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms