Protein–RNA interactions for Protein: Q60707

Tbx2, T-box transcription factor TBX2, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx2Q60707 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tbx2Q60707 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tbx2Q60707 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx2Q60707 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms