Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxd4Q60688 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd4Q60688 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms