Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgaeQ60677 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgaeQ60677 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgaeQ60677 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgaeQ60677 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms