Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClpbQ60649 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ClpbQ60649 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms