Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm1Q60636 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm1Q60636 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm1Q60636 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms