Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CttnQ60598 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CttnQ60598 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CttnQ60598 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CttnQ60598 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms