Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mybpc2Q5XKE0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mybpc2Q5XKE0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms