Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF20Q5VTR2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF20Q5VTR2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms