Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc5a6Q5U4D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc5a6Q5U4D8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms