Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brip1Q5SXJ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brip1Q5SXJ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms