Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssh2Q5SW75 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh2Q5SW75 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms