Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynrgQ5SV85 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynrgQ5SV85 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms