Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc42Q5SV66 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc42Q5SV66 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms