Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbs12Q5SUD9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bbs12Q5SUD9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bbs12Q5SUD9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms