Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf215Q5SPX3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf215Q5SPX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms