Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Brsk1Q5RJI5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brsk1Q5RJI5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Brsk1Q5RJI5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Brsk1Q5RJI5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Brsk1Q5RJI5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Brsk1Q5RJI5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Brsk1Q5RJI5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brsk1Q5RJI5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms