Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rapgef6Q5NCJ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rapgef6Q5NCJ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rapgef6Q5NCJ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms