Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim58Q5NCC9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim58Q5NCC9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms