Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sdr39u1Q5M8N4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr39u1Q5M8N4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sdr39u1Q5M8N4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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