Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prkaa1Q5EG47 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkaa1Q5EG47 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms