Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rtl5Q5DTT4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rtl5Q5DTT4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms