Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT1

Nexmif, Neurite extension and migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexmifQ5DTT1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NexmifQ5DTT1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NexmifQ5DTT1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NexmifQ5DTT1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms