Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy3Q5DTK1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy3Q5DTK1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chsy3Q5DTK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms