Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2f8Q58FA4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms