Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme2Q56A04 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme2Q56A04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms