Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms