Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
6430531B16RikQ3V2J1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430531B16RikQ3V2J1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms