Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc110Q3V125 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc110Q3V125 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc110Q3V125 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms