Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd53Q3V0J4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd53Q3V0J4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms