Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr7Q3V0I2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prr7Q3V0I2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr7Q3V0I2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms