Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms